艾略特C. 布什

生物学教授

F.W. 奥林科学中心1240室
普拉特大道301号.
Claremont, CA 91711
909.607.0653
Eliot_布什@sheep-lovely.com

时间/日历 (可通过g查看.sheep-lovely.com账户)

教育及专业经历

• 哈佛大学AB
• 加州理工学院博士
• 美国芝加哥大学博士后

研究兴趣

我们目前的工作是在微生物基因组进化领域. 我们已经开发了一种计算方法来重建基因组岛插入在密切相关的微生物分支中的历史(链接到xenoGI网站). 我们现在正在改进这种方法的各个方面, 并用它来研究生命之树的水平迁移模式. 更多的信息可以在我们的网站上找到 实验室网站.

面向更广泛的受众

• 我们的进化历史可以告诉我们人工智能的未来 (科学美国人11/2023)
• 在人类最早祖先出现的地方，时间的意义 (科学美国人6/2020)
• 视频: 我们怎么知道大流行冠状病毒来自哪里?
• 博客

教学

• 生物46:生物导论
• CS5 Green:以生物学为主题的计算机科学入门
• 生物23:生物实验室
• 生物118b:计算生物学导论
• 生物188:高级计算生物学
• 生物129:人类进化

出版物

计算生物学教材

• 里伯斯金-哈达斯R 布什E. 生物学家的计算:Python编程和原理. 剑桥大学出版社. 2014.

文章及章节选集

• 刘* N., *冈萨雷斯助教, *费舍尔J, *香港C, *约翰逊M, 马哈特R, * Mugnatto F, * Soh R, * Somji年代, Wirth JS, 里伯斯金-哈达斯R 布什EC. xenoGI 3:使用DTLOR模型重建微生物分支中基因家族的进化. BMC生物信息学. 24(295). 2023.
• Wirth JS, 布什EC. 用PHANTASM自动化微生物分类学工作流程:微生物分类学和系统学的系统发育分析. 核酸研究. 51(7). 2023.
• *刘杰，马哈特R， *Liu I， *Santichaivekin S， 布什E里伯斯金-哈达斯R. DTLOR模型中的最大简约对账. BMC生物信息学. 22(394). 2021.
• 布什EC， 阿道夫 SC, Donaldson-Matasci MC, Hur JH，和Schulz D. 将编程、建模和数据分析纳入生物学入门课程. 大学科学教学学报. 50(3). 2021. [PDF]
• 布什EC, *克拉克AE, * DeRanek CA, *英格, *福尔曼J, *健康K, *李AB, Stoebel DM, 王* Z, *威尔伯米, 吴* H. xenoGI:重建在密切相关的细菌分支中基因组岛插入的历史. BMC生物信息学. 19(32). 2018. [bioRxiv预印本]
• 黄* GT, Bonocora RP, * Schep一, *分为SM, 方AJ, * Shull LM, Batachari勒, *狄龙M, 埃文斯C, *贝克CJ, 布什EC， Hardin J, Wade JT, Stoebel DM. 大肠杆菌K-12中不同RpoS水平的全基因组转录响应. J Bacteriol. 199:e00755-16. 2017.
• Drewell,风湿性关节炎, 布什EC， *王国强，*Beeler m， *Stringham JL, Lim J, Gouldie F, Oldroyd BP. 蜜蜂从卵子到精子的动态DNA甲基化循环. 发展. 141(13):2702-11. 2014.
• *Beeler, SM， 黄* GT，郑建民， 布什EC， Remnant EJ, Oldroyd BP, Drewell RA. 珠宝蜂(Nasonia vitripennis)全基因组DNA甲基化图谱. G3:基因、基因组、遗传学, g3-113. 2013.
• 布什EC， Clark AE*， DeBoever CM*， Haynes LE*， Hussain S*， Ma S*， McDermott MM*， Novak AM*， Wentworth JS*. (2012) 负协同在代谢调节和体内平衡中的作用建模. 《太阳2注册平台》 7(11): e48920.
• 刘建军，刘建军，刘建军，刘建军，刘建军，刘建军 & 布什EC. 背景依赖性替代偏差在人类基因组中各不相同. BMC生物信息学, 11(462). 2010.

*本科作者

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